В 2026–2027 годах Rail Baltic Estonia будет не хватать €380–450 млн. По словам Салометса, деньги должны поступить в виде комбинации средств Европейского союза, выручки от продажи квот на выбросы углекислого газа, а также в некоторой степени за счет заемных средств.
В 2028–2030 годах Rail Baltic рассчитывает получить финансирование уже из следующего бюджетного периода ЕС.