При работе укороченной полосы действует только региональное авиасообщение – по Сибири. Первый рейс после открытия ВПП вылетит из Томска в Новосибирск в 11.35 (07.35). Его будет выполнять авиакомпания S7.
Реконструкция взлетно-посадочной полосы началась в 2021 году, прошлым летом аэропорт переходил на сокращенный режим полетов из-за работ на ней. Тогда было сделано 1550 из 2500 м.
Аэропорт Томска является одним из наиболее интенсивно развивающихся региональных аэропортов федерального значения. Находится в собственности холдинга «Новапорт» (входит в группу компаний AEON Corporation). Пропускная способность аэропорта – 600 пассажиров в час: 400 человек на внутренних и 200 – на международных авиалиниях. В 2020 году пассажиропоток сократился вдвое из-за пандемии. По итогам 2021-го он вырос на 41% – до 494 тыс. человек в год, но еще не достиг допандемийных показателей – более 750 тыс. человек в год.